משטר הפעלות מגדיר את פעולת מערכות החירום המותקנות בבניין (אמצעי זיהוי והתרעת אש, מערכת מסירת הודעות אוטומטית, מפוחי שחרור עשן, מערכת מיזוג אוויר מרכזית, מעליות, דלתות מבוקרות כניסה ועוד), בזמן אירוע שריפה.
עקרונות משטר ההפעלות נקבעים לפי הוראת נציב 536, אך לכל מבנה מותאם ספציפית משטר הפעלות, בהתאם לנתוני המבנה ולמערכות המותקנות בו.